Способа сделать всеръез и надолго водонепроницаемым нет.
Смысла тоже. Потому что тогда проще будет резиновые сапоги одеть.
При активной эксплуатации любое средство счистится/сдерется/вымоется со временем.

Есть способы сделать временно и частично водонепроницаемыми.

По возрастающей:

1. Обыкновенный сапожный крем.
2. Смалец.
3. Намазать специальным воском (продается в магазинах) и поставить в теплое место дня на 3 (чтобы пропитались).
4. Намазать автомобильным силиконовым герметиком.

З.Ы. Во всех случаях дополнительный эффект обеспечит смазывание внутренней части сапог вазелином.